Рак – результат накопления мутаций и эпигенетических изменений, приводящих к нарушениям регуляции клеточного цикла, контроля целостности генома, апоптоза, дифференцировки, морфогенетических реакций. Вариации генных последовательностей определяют индивидуальные реакции организма на условия окружающей среды, способствуя развитию раковых заболеваний.
Мы представляем результаты молекулярно-эпидемиологического исследования жителей Казахстана больных раком пищевода (РП – 100 чел.), шейки матки (РШМ – 217 чел.), колоректальным раком (КРР – 249 чел.) и когорты условно здоровых лиц (115, 160 и 245 человек, соответственно).
В качестве кандидатных маркеров предрасположенности к развитию РП и РШМ исследованы полиморфизмы генов GSTM1, GSTT1, GSTР1, XRCC1, XRCC3, АТМ, BRCA1, TP53 и CCND1, а также паттерн метилирования промоторов BRCA1, Fas, и Casp8.
Для спорадических вариантов КРР были исследованы полиморфизмы DСС, TP53, hMLH1, GST-генов.
Критические районы генов APC, MLH1, MLH1, KRAS и TP53, ассоциированные с известными наследственными синдромами, изучены для возможных семейных случаев КРР (28 пациентов с ранним развитием рака (28-50 лет), включая 16 пациентов с КРР, отягощенным семейной историей).
В результате определены панели генетических маркеров развития спорадических вариантов изученных видов рака:
1) РП – делеции GSTT1 (OR=3,45) и GSTM1 (OR=8,08); XRCC3 – Met241Met (OR=7,40); XRCC1 – Gln399Gln (OR=16,33); TP53 – Pro72Pro (OR=3,34), CCND1 – A870А (OR=2,92); метилированные промоторы Fas (OR=25,67) и Casp8 (OR=8,80);
2) РШМ – делеции GSTT1 (OR=3,99) и GSTM1 (OR=6,50); XRCC1 – Arg194Arg (OR=1,58); XRCC1 – Gln399Gln (OR=3,83), XRCC3 – Met241Met (OR=2,84) и TP53 – Arg72Arg (OR=3,96); метилированные промоторы BRCA1 (OR=16,33) и Casp8 (OR=21,46);
3) КРР – DCC – 32008376G/G и G/A (OR=3,45); MLH1 – G93G (OR=1,45), TP53 – Pro72Pro (OR=3,80); делеции GSTM1 (OR=1,83).
Обследование молодых пациентов с КРР позволило выявить: редкие варианты нуклеотидных замен по гену TP53 (интрон 4 – c.376 – 19C>T; интрон 9 – c.993 +12T>C); нуклеотидную замену в интроне 15 гена MLH1 (c.1732 – 90C>A), представленную у 15 пациентов; известные полиморфизмы генов MLH1 (8 экзон – A655G/Ile219Val), MSH2 (7 экзон – C1168T/Leu390Phe), APC (15 экзон – G3949C/p.Glu1317Gln и rs41115 – G4479A); делецию нуклеотида в 15 экзоне APC гена (c.3613delA/p.Ser1205fs) у 2 пациентов-братьев с аденоматозным полипозом. Мутации 12 кодона KRAS гена обнаружены у 53,6% злокачественных случаев КРР.
Полученные данные имеют перспективу использования для создания тест-систем предрасположенности к развитию изученных видов рака, что позволит обогатить возможности скрининга и окажет влияние на снижение онкологической заболеваемости и смертности в Казахстане.